Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VhlP40338 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VhlP40338 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VhlP40338 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VhlP40338 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VhlP40338 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VhlP40338 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VhlP40338 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VhlP40338 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VhlP40338 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VhlP40338 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VhlP40338 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VhlP40338 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VhlP40338 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VhlP40338 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VhlP40338 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VhlP40338 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VhlP40338 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VhlP40338 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VhlP40338 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VhlP40338 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VhlP40338 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VhlP40338 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VhlP40338 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VhlP40338 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VhlP40338 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VhlP40338 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VhlP40338 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VhlP40338 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VhlP40338 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VhlP40338 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VhlP40338 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VhlP40338 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VhlP40338 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VhlP40338 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VhlP40338 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VhlP40338 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VhlP40338 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VhlP40338 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VhlP40338 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VhlP40338 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VhlP40338 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VhlP40338 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VhlP40338 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VhlP40338 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VhlP40338 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VhlP40338 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VhlP40338 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VhlP40338 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VhlP40338 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VhlP40338 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VhlP40338 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VhlP40338 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VhlP40338 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VhlP40338 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VhlP40338 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VhlP40338 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VhlP40338 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VhlP40338 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VhlP40338 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VhlP40338 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VhlP40338 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VhlP40338 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VhlP40338 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VhlP40338 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VhlP40338 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VhlP40338 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VhlP40338 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VhlP40338 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VhlP40338 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VhlP40338 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VhlP40338 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VhlP40338 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VhlP40338 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VhlP40338 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VhlP40338 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VhlP40338 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VhlP40338 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VhlP40338 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VhlP40338 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VhlP40338 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VhlP40338 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VhlP40338 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VhlP40338 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VhlP40338 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VhlP40338 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VhlP40338 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VhlP40338 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VhlP40338 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VhlP40338 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms