Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KdrP35918 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KdrP35918 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
KdrP35918 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
KdrP35918 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KdrP35918 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KdrP35918 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
KdrP35918 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KdrP35918 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KdrP35918 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KdrP35918 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KdrP35918 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KdrP35918 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KdrP35918 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KdrP35918 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
KdrP35918 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
KdrP35918 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KdrP35918 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KdrP35918 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KdrP35918 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
KdrP35918 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
KdrP35918 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KdrP35918 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KdrP35918 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KdrP35918 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
KdrP35918 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
KdrP35918 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
KdrP35918 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KdrP35918 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KdrP35918 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KdrP35918 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KdrP35918 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
KdrP35918 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KdrP35918 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
KdrP35918 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KdrP35918 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
KdrP35918 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
KdrP35918 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KdrP35918 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KdrP35918 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
KdrP35918 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
KdrP35918 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KdrP35918 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
KdrP35918 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KdrP35918 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
KdrP35918 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KdrP35918 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KdrP35918 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KdrP35918 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KdrP35918 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
KdrP35918 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KdrP35918 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
KdrP35918 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
KdrP35918 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
KdrP35918 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KdrP35918 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
KdrP35918 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KdrP35918 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
KdrP35918 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
KdrP35918 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KdrP35918 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KdrP35918 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KdrP35918 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KdrP35918 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KdrP35918 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KdrP35918 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
KdrP35918 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KdrP35918 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KdrP35918 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KdrP35918 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KdrP35918 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KdrP35918 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KdrP35918 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KdrP35918 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
KdrP35918 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KdrP35918 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KdrP35918 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
KdrP35918 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
KdrP35918 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
KdrP35918 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KdrP35918 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KdrP35918 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KdrP35918 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KdrP35918 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KdrP35918 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
KdrP35918 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
KdrP35918 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KdrP35918 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KdrP35918 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KdrP35918 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KdrP35918 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KdrP35918 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KdrP35918 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
KdrP35918 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
KdrP35918 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KdrP35918 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KdrP35918 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KdrP35918 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
KdrP35918 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
KdrP35918 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms