Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Folr1P35846 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Folr1P35846 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Folr1P35846 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Folr1P35846 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Folr1P35846 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Folr1P35846 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Folr1P35846 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Folr1P35846 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Folr1P35846 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Folr1P35846 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms