Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Hoxa2P31245 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hoxa2P31245 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxa2P31245 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxa2P31245 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms