Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Defa2P28309 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa2P28309 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa2P28309 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa2P28309 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa2P28309 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa2P28309 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Defa2P28309 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Defa2P28309 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa2P28309 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa2P28309 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa2P28309 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.2 ms