Protein–RNA interactions for Protein: P26954

Csf2rb2, Interleukin-3 receptor class 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2rb2P26954 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Csf2rb2P26954 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Csf2rb2P26954 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Csf2rb2P26954 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Csf2rb2P26954 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms