Protein–RNA interactions for Protein: P24860

Ccnb1, G2/mitotic-specific cyclin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1P24860 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnb1P24860 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnb1P24860 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnb1P24860 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnb1P24860 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnb1P24860 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnb1P24860 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnb1P24860 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnb1P24860 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnb1P24860 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnb1P24860 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms