Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Cdk11bP24788 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Cdk11bP24788 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Cdk11bP24788 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cdk11bP24788 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Cdk11bP24788 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cdk11bP24788 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Cdk11bP24788 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms