Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxd8P23463 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hoxd8P23463 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hoxd8P23463 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxd8P23463 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms