Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Ms4a2P20490 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ms4a2P20490 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ms4a2P20490 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ms4a2P20490 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ms4a2P20490 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms