Protein–RNA interactions for Protein: P19973

Lsp1, Lymphocyte-specific protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsp1P19973 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lsp1P19973 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lsp1P19973 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lsp1P19973 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lsp1P19973 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lsp1P19973 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms