Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NelfeP19426 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfeP19426 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfeP19426 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfeP19426 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NelfeP19426 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfeP19426 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfeP19426 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NelfeP19426 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfeP19426 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NelfeP19426 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfeP19426 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NelfeP19426 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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