Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ctla2aP12399 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ctla2aP12399 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ctla2aP12399 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctla2aP12399 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctla2aP12399 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctla2aP12399 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctla2aP12399 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ctla2aP12399 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctla2aP12399 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ctla2aP12399 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms