Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tcp1P11983 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tcp1P11983 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tcp1P11983 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tcp1P11983 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcp1P11983 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms