Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prf1P10820 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prf1P10820 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prf1P10820 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prf1P10820 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prf1P10820 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prf1P10820 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prf1P10820 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prf1P10820 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prf1P10820 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prf1P10820 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prf1P10820 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prf1P10820 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms