Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P10404 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P10404 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P10404 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P10404 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P10404 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P10404 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P10404 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P10404 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P10404 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P10404 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P10404 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
P10404 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
P10404 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P10404 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P10404 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P10404 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P10404 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P10404 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P10404 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P10404 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P10404 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P10404 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P10404 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P10404 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P10404 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P10404 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P10404 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P10404 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P10404 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P10404 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
P10404 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P10404 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P10404 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P10404 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
P10404 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P10404 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P10404 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P10404 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P10404 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P10404 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P10404 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P10404 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P10404 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
P10404 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P10404 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P10404 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P10404 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P10404 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P10404 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
P10404 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
P10404 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P10404 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
P10404 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P10404 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P10404 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
P10404 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P10404 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P10404 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P10404 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P10404 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
P10404 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
P10404 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P10404 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P10404 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P10404 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
P10404 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
P10404 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
P10404 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
P10404 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
P10404 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P10404 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P10404 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
P10404 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
P10404 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
P10404 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P10404 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
P10404 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
P10404 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.3 ms