Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Becn2P0DM65 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Becn2P0DM65 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Becn2P0DM65 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Becn2P0DM65 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Becn2P0DM65 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms