Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NclP09405 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NclP09405 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
NclP09405 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NclP09405 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NclP09405 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NclP09405 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NclP09405 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NclP09405 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NclP09405 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NclP09405 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NclP09405 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NclP09405 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NclP09405 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NclP09405 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NclP09405 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NclP09405 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NclP09405 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NclP09405 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NclP09405 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NclP09405 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NclP09405 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NclP09405 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NclP09405 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NclP09405 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NclP09405 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
NclP09405 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NclP09405 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NclP09405 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NclP09405 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NclP09405 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NclP09405 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NclP09405 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NclP09405 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NclP09405 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NclP09405 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NclP09405 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NclP09405 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NclP09405 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
NclP09405 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NclP09405 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NclP09405 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NclP09405 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NclP09405 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NclP09405 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
NclP09405 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NclP09405 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NclP09405 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
NclP09405 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NclP09405 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NclP09405 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NclP09405 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NclP09405 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NclP09405 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NclP09405 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NclP09405 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NclP09405 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NclP09405 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
NclP09405 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NclP09405 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NclP09405 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NclP09405 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NclP09405 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NclP09405 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NclP09405 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NclP09405 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NclP09405 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NclP09405 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NclP09405 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NclP09405 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NclP09405 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NclP09405 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NclP09405 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NclP09405 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
NclP09405 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NclP09405 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NclP09405 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NclP09405 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NclP09405 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NclP09405 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NclP09405 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NclP09405 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NclP09405 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NclP09405 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NclP09405 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NclP09405 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NclP09405 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NclP09405 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NclP09405 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NclP09405 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NclP09405 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NclP09405 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NclP09405 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NclP09405 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NclP09405 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NclP09405 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NclP09405 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NclP09405 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NclP09405 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NclP09405 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms