Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp1P08042 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp1P08042 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp1P08042 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zfp1P08042 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zfp1P08042 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms