Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01794 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01794 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01794 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01794 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01794 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01794 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01794 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01794 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01794 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01794 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01794 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01794 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01794 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01794 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01794 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01794 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01794 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01794 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01794 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01794 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01794 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01794 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01794 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01794 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01794 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01794 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01794 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01794 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01794 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01794 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01794 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01794 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01794 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01794 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01794 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01794 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01794 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01794 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01794 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01794 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01794 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01794 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01794 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01794 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01794 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01794 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01794 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01794 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01794 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01794 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01794 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01794 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01794 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01794 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01794 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01794 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01794 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01794 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01794 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01794 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01794 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01794 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01794 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01794 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01794 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01794 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01794 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01794 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01794 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01794 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01794 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01794 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01794 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms