Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P01678 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01678 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
P01678 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01678 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
P01678 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01678 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
P01678 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01678 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01678 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01678 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01678 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01678 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01678 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
P01678 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01678 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
P01678 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
P01678 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
P01678 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01678 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
P01678 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01678 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01678 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01678 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01678 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
P01678 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01678 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01678 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01678 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01678 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01678 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
P01678 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01678 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
P01678 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01678 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01678 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01678 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01678 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01678 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
P01678 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
P01678 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01678 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
P01678 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
P01678 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
P01678 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01678 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01678 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01678 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
P01678 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01678 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01678 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01678 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P01678 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01678 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01678 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01678 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
P01678 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01678 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P01678 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P01678 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01678 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01678 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P01678 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P01678 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01678 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01678 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P01678 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
P01678 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01678 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01678 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P01678 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P01678 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01678 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01678 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01678 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01678 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P01678 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01678 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P01678 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
P01678 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01678 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
P01678 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
P01678 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms