Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01668 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P01668 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01668 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01668 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P01668 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01668 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01668 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01668 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01668 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01668 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01668 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01668 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01668 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01668 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01668 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01668 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01668 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01668 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01668 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01668 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01668 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01668 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01668 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
P01668 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01668 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01668 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01668 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01668 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01668 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01668 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01668 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01668 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01668 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01668 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01668 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01668 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01668 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01668 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01668 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01668 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01668 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01668 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01668 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01668 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01668 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01668 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01668 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01668 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01668 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01668 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P01668 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01668 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01668 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01668 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
P01668 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01668 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01668 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01668 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01668 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01668 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01668 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
P01668 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01668 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01668 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01668 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01668 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P01668 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P01668 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01668 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01668 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01668 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01668 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01668 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01668 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01668 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P01668 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01668 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01668 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01668 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01668 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01668 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01668 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01668 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01668 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01668 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01668 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
P01668 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01668 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01668 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01668 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
P01668 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
P01668 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01668 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01668 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01668 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01668 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01668 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01668 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P01668 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms