Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Igk-V19-17P01633 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Igk-V19-17P01633 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Igk-V19-17P01633 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Igk-V19-17P01633 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms