Protein–RNA interactions for Protein: O89109

Kcnn4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn4O89109 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnn4O89109 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn4O89109 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn4O89109 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn4O89109 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnn4O89109 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnn4O89109 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kcnn4O89109 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcnn4O89109 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms