Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp2O88623 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp2O88623 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp2O88623 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp2O88623 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp2O88623 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp2O88623 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp2O88623 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp2O88623 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp2O88623 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp2O88623 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Usp2O88623 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp2O88623 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp2O88623 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp2O88623 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms