Protein–RNA interactions for Protein: O88396

Grpel2, GrpE protein homolog 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel2O88396 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Grpel2O88396 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Grpel2O88396 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Grpel2O88396 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grpel2O88396 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms