Protein–RNA interactions for Protein: O70401

Tspan6, Tetraspanin-6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan6O70401 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tspan6O70401 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tspan6O70401 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tspan6O70401 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Tspan6O70401 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tspan6O70401 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms