Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atp9aO70228 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp9aO70228 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atp9aO70228 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp9aO70228 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp9aO70228 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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