Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cd70O55237 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cd70O55237 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd70O55237 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd70O55237 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd70O55237 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd70O55237 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cd70O55237 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd70O55237 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cd70O55237 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd70O55237 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cd70O55237 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd70O55237 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd70O55237 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd70O55237 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cd70O55237 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms