Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap1O55125 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nipsnap1O55125 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nipsnap1O55125 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nipsnap1O55125 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms