Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dsg2O55111 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dsg2O55111 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dsg2O55111 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dsg2O55111 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dsg2O55111 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms