Protein–RNA interactions for Protein: O54863

Tssk2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk2O54863 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tssk2O54863 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tssk2O54863 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tssk2O54863 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tssk2O54863 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tssk2O54863 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tssk2O54863 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk2O54863 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk2O54863 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tssk2O54863 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tssk2O54863 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk2O54863 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tssk2O54863 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tssk2O54863 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tssk2O54863 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tssk2O54863 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tssk2O54863 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tssk2O54863 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tssk2O54863 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms