Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EdaO54693 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EdaO54693 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EdaO54693 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EdaO54693 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EdaO54693 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EdaO54693 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EdaO54693 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EdaO54693 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EdaO54693 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EdaO54693 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EdaO54693 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EdaO54693 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EdaO54693 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EdaO54693 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EdaO54693 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EdaO54693 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EdaO54693 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EdaO54693 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EdaO54693 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EdaO54693 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EdaO54693 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EdaO54693 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EdaO54693 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EdaO54693 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EdaO54693 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EdaO54693 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EdaO54693 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EdaO54693 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EdaO54693 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EdaO54693 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EdaO54693 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EdaO54693 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EdaO54693 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EdaO54693 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EdaO54693 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EdaO54693 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EdaO54693 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EdaO54693 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EdaO54693 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EdaO54693 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EdaO54693 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EdaO54693 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EdaO54693 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EdaO54693 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EdaO54693 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EdaO54693 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EdaO54693 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EdaO54693 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EdaO54693 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EdaO54693 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EdaO54693 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EdaO54693 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EdaO54693 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EdaO54693 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EdaO54693 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EdaO54693 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EdaO54693 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EdaO54693 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EdaO54693 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EdaO54693 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EdaO54693 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EdaO54693 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EdaO54693 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EdaO54693 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EdaO54693 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EdaO54693 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EdaO54693 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EdaO54693 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EdaO54693 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EdaO54693 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EdaO54693 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EdaO54693 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EdaO54693 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EdaO54693 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EdaO54693 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EdaO54693 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EdaO54693 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EdaO54693 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EdaO54693 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EdaO54693 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EdaO54693 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EdaO54693 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EdaO54693 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EdaO54693 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EdaO54693 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EdaO54693 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EdaO54693 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EdaO54693 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EdaO54693 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EdaO54693 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EdaO54693 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EdaO54693 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EdaO54693 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EdaO54693 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EdaO54693 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EdaO54693 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EdaO54693 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EdaO54693 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EdaO54693 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms