Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek2O35942 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek2O35942 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek2O35942 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nek2O35942 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek2O35942 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek2O35942 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek2O35942 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nek2O35942 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek2O35942 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek2O35942 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nek2O35942 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek2O35942 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nek2O35942 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms