Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chil3O35744 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chil3O35744 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chil3O35744 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chil3O35744 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chil3O35744 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chil3O35744 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chil3O35744 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chil3O35744 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chil3O35744 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chil3O35744 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chil3O35744 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chil3O35744 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chil3O35744 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chil3O35744 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms