Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sema6aO35464 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6aO35464 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6aO35464 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6aO35464 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6aO35464 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sema6aO35464 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6aO35464 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sema6aO35464 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6aO35464 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6aO35464 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6aO35464 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6aO35464 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6aO35464 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6aO35464 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6aO35464 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6aO35464 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6aO35464 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6aO35464 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6aO35464 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6aO35464 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sema6aO35464 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sema6aO35464 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema6aO35464 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema6aO35464 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema6aO35464 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sema6aO35464 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sema6aO35464 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms