Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EllO08856 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EllO08856 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EllO08856 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EllO08856 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EllO08856 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EllO08856 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EllO08856 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EllO08856 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EllO08856 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EllO08856 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EllO08856 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EllO08856 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EllO08856 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EllO08856 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EllO08856 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EllO08856 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EllO08856 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EllO08856 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EllO08856 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EllO08856 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EllO08856 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EllO08856 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EllO08856 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EllO08856 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EllO08856 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EllO08856 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EllO08856 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EllO08856 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EllO08856 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EllO08856 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EllO08856 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EllO08856 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EllO08856 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EllO08856 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EllO08856 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EllO08856 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EllO08856 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EllO08856 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EllO08856 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EllO08856 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EllO08856 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EllO08856 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EllO08856 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EllO08856 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EllO08856 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EllO08856 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EllO08856 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EllO08856 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EllO08856 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EllO08856 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EllO08856 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EllO08856 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EllO08856 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EllO08856 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EllO08856 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
EllO08856 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EllO08856 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EllO08856 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EllO08856 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EllO08856 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EllO08856 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EllO08856 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EllO08856 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EllO08856 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EllO08856 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EllO08856 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EllO08856 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EllO08856 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EllO08856 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EllO08856 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EllO08856 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EllO08856 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EllO08856 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EllO08856 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EllO08856 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EllO08856 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EllO08856 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EllO08856 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EllO08856 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EllO08856 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EllO08856 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EllO08856 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EllO08856 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms