Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vwa3bJ9JI28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vwa3bJ9JI28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vwa3bJ9JI28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vwa3bJ9JI28 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vwa3bJ9JI28 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vwa3bJ9JI28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms