Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2056J3QQ02 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gm2056J3QQ02 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm2056J3QQ02 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm2056J3QQ02 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 807 ms