Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17577J3QNF7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm17577J3QNF7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm17577J3QNF7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm17577J3QNF7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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