Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Ccdc180J3QNE4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Ccdc180J3QNE4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
Ccdc180J3QNE4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Ccdc180J3QNE4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Ccdc180J3QNE4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Ccdc180J3QNE4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC41.89■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Ccdc180J3QNE4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Ccdc180J3QNE4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Ccdc180J3QNE4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Ccdc180J3QNE4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Ccdc180J3QNE4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ccdc180J3QNE4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ccdc180J3QNE4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
Ccdc180J3QNE4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC41.77■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Ccdc180J3QNE4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Ccdc180J3QNE4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.4 ms