Protein–RNA interactions for Protein: J3QN52

Gm16427, Predicted gene 16427, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16427J3QN52 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm16427J3QN52 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm16427J3QN52 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm16427J3QN52 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm16427J3QN52 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm16427J3QN52 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms