Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lipo1J3QME6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lipo1J3QME6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lipo1J3QME6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lipo1J3QME6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Lipo1J3QME6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms