Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Usp17lcG5E8I7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp17lcG5E8I7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp17lcG5E8I7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp17lcG5E8I7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp17lcG5E8I7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp17lcG5E8I7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms