Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Pcf11G3X9Z4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pcf11G3X9Z4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Pcf11G3X9Z4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pcf11G3X9Z4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Pcf11G3X9Z4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Pcf11G3X9Z4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Pcf11G3X9Z4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms