Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trim15G3UY57 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim15G3UY57 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim15G3UY57 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trim15G3UY57 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms