Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp9yF8VPU6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp9yF8VPU6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp9yF8VPU6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp9yF8VPU6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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