Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pagr1bF6V0H0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pagr1bF6V0H0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pagr1bF6V0H0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pagr1bF6V0H0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pagr1bF6V0H0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms