Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17430F6RSK3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17430F6RSK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17430F6RSK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17430F6RSK3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17430F6RSK3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17430F6RSK3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm17430F6RSK3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm17430F6RSK3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm17430F6RSK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm17430F6RSK3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1069.1 ms