Protein–RNA interactions for Protein: F2Z472

Svs3a, Seminal vesicle secretory protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs3aF2Z472 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Svs3aF2Z472 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Svs3aF2Z472 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Svs3aF2Z472 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Svs3aF2Z472 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Svs3aF2Z472 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms